轉(zhuǎn)染級BAC/PAC大型質(zhì)粒提取試劑盒 核酸提取
常規(guī)的離心柱型質(zhì)粒抽提試劑盒并不適用于BAC/PAC/P1/Cosmid等大型質(zhì)粒DNA的抽提。這主要是因為大型質(zhì)粒DNA分子量很大,常常會超過100kb而且一般拷貝數(shù)低產(chǎn)量低,使用常規(guī)的離心柱吸附膜吸附效率和產(chǎn)量很低而且過膜會打斷這些大分子量的質(zhì)粒DNA。轉(zhuǎn)染級BAC/PAC大型質(zhì)粒提取試劑盒 核酸提取
轉(zhuǎn)染級BAC PAC大型質(zhì)粒提取試劑盒(溶液型)
轉(zhuǎn)染級BAC/PAC大型質(zhì)粒提取試劑盒 核酸提取
目錄號:31210
v 適用范圍:
適用于BAC/PAC/P1/Cosmid等大型質(zhì)粒制備
v 試劑盒組成、儲存、穩(wěn)定性:
試劑盒組成 | 保存 | 20次(31210-20) |
RNaseA (10mg/ml) | -20℃ | 1.3ml |
溶液P1 | 4℃ | 130ml |
溶液P2 | 室溫 | 100 ml |
溶液PⅢ | 室溫 | 110 ml |
雜質(zhì)清除劑A | 室溫 | 3 ml |
雜質(zhì)清除劑B | 室溫 | 30 ml |
內(nèi)毒素清除劑 | -20℃ | 10 ml |
本試劑盒在室溫儲存12個月不影響使用效果。
儲存事項:
1. 第一次使用時,將試劑盒所帶全部的RNase A加入溶液P1后(終濃度100μg /ml)置于4℃保存。如果溶液P1中RNase A失活,提取的質(zhì)??赡軙祀s有微量RNA殘留,在溶液P1中補加RNase A即可。
2. 內(nèi)毒素清除劑在4℃可保存一個月,如果要長期保存,建議保存在-20℃!
3. 環(huán)境溫度低時溶液P2中SDS可能會析出出現(xiàn)渾濁或者沉淀,可在37℃水浴加熱幾分鐘,即可恢復(fù)澄清,不要劇烈搖晃,以免形成過量的泡沫。
4. 避免試劑長時間暴露于空氣中產(chǎn)生揮發(fā)、氧化、pH值變化,各溶液使用后應(yīng)及時蓋緊蓋子。
v 產(chǎn)品介紹:
常規(guī)的離心柱型質(zhì)粒抽提試劑盒并不適用于BAC/PAC/P1/Cosmid等大型質(zhì)粒DNA的抽提。這主要是因為大型質(zhì)粒DNA分子量很大,常常會超過100kb而且一般拷貝數(shù)低產(chǎn)量低,使用常規(guī)的離心柱吸附膜吸附效率和產(chǎn)量很低而且過膜會打斷這些大分子量的質(zhì)粒DNA。本試劑盒采用改進堿裂解法從培養(yǎng)菌中提取質(zhì)粒DNA,采用du特的溶液配方和內(nèi)毒素清除試劑,只需要幾次簡單離心去除蛋白質(zhì)、多糖、內(nèi)毒素、RNA等雜質(zhì),獲得高質(zhì)量的質(zhì)粒DNA。純化DNA的OD260/280通常在1.8左右,得到的質(zhì)??芍苯討?yīng)用于細胞轉(zhuǎn)染甚至動物體內(nèi)實驗等對DNA純度要求很高的工作中。純化后期過程均在1.5ml離心管中操作,方法簡單,不需特殊設(shè)備,無需過柱,不用酚氯仿抽提;基本可wan全回收細菌裂解釋放出的質(zhì)粒,不必擔(dān)心質(zhì)粒DNA的丟失。本方法提取純化質(zhì)粒DNA,對質(zhì)粒損傷小,即使是10kb甚至100kb以上的大型質(zhì)?;虺笮虰AC/PAC質(zhì)粒,只要堿裂解法能夠提取,就可以有效純化。此外溶液型的試劑可以按照比例放大縮小進行小提/中提/大提,最后可選擇任意小體積溶解質(zhì)粒,濃度可高達3μg/μl。
v 產(chǎn)品特點:
1. 不需要使用有毒的苯fen,lv仿等試劑,也不需要乙醇沉淀??焖?、 方便、從150 ml大腸桿菌LB((Luria-Bertani)培養(yǎng)液中,可快速提取典型產(chǎn)量30-50μg高純度BAC質(zhì)粒DNA,提取率達80-90 %。
2. 獲得的質(zhì)粒產(chǎn)量高,超螺旋比例高,純度好,可直接用于轉(zhuǎn)染、測序、文庫等各種分子生物學(xué)實驗。
3. 內(nèi)毒素含量極低(<10 EU/μg DNA),可直接應(yīng)用于細胞轉(zhuǎn)染。
v 注意事項:
1. 提取的質(zhì)粒量與細菌培養(yǎng)濃度、質(zhì)??截悢?shù)等因素有關(guān)。如果所提質(zhì)粒為低拷貝質(zhì)粒或大于10kb 的大質(zhì)粒,應(yīng)加大菌體使用量,同時按比例增加P1、P2、PⅢ的用量。
2. 提取大質(zhì)粒時操作動作要輕柔,應(yīng)該使用剪大了開口的吸頭,防止機械剪切對DNA的損壞。
3. DNA沉淀液沉淀離心后,可能看不到明顯沉淀。如未見沉淀,擔(dān)心DNA丟失,可保留上清液,待完成全部操作后電泳鑒定,以確定是否獲得終產(chǎn)物(數(shù)百微克DNA離心沉淀在管的側(cè)壁上,可能無法看到明顯團塊)。
4. 得到的質(zhì)粒DNA可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度。OD260值為1相當(dāng)于大約50μg/ml DNA。電泳可能為單一條帶,也可能為2條或者多條DNA條帶,這主要是不同程度的超螺旋構(gòu)象質(zhì)粒泳動位置不一造成,與提取物培養(yǎng)時間長短、提取時操作劇烈程度等有關(guān)。本公司產(chǎn)品正常操作情況下基本超螺旋可以超過95%。
v 操作步驟:(實驗前請先閱讀注意事項)
e 提示:將RNase A全部加入溶液P1中,混勻,使用后置于2-8℃保存。
1. 取過夜培養(yǎng)菌150 ml左右菌液(最大不超過180ml-200ml),裝入合適的離心瓶中,10,000 x g于4℃離心2 min沉淀菌體,wan全棄除上清。
2. 加入5 ml 溶液P1,充分混懸震蕩菌體沉淀,使其wan全分散開,至無絮塊存在。細菌懸液移入50 ml離心管中,室溫放置3~5 min。
如果有未che底混勻的菌塊,會影響裂解,導(dǎo)致提取量和純度偏低。
3. 加入5 ml 溶液P2,輕輕顛倒離心管6~8次,室溫放置4-5 min,使細菌wan全裂解,溶液透明。
溫和地混合,不要劇烈震蕩,以免基因組DNA剪切斷裂!所用時不應(yīng)超過5分鐘!以免質(zhì)粒受到破壞。此時菌液應(yīng)變得清亮粘稠,如果菌體少,很快清亮粘稠后就可以做下一步,不是一定要準(zhǔn)確的5分鐘。如果未變得清亮,可能由于菌體過多,裂解不che底,應(yīng)減少菌體量。
4. 加5 ml溶液PⅢ,立即顛倒離心管6~8次,充分混勻,至白色絮狀物產(chǎn)生。上述裂解液于4℃ 12,000~16,000 x g離心10~15 min,小心吸出上清,移入新的50 ml離心管中。
加入溶液PⅢ后應(yīng)該立即混勻,以免產(chǎn)生SDS的局部沉淀。
5. 加入10 ml 異丙醇,顛倒離心管,充分混勻。
6. 于4℃ 12,000~16,000 x g離心10 min,小心棄去上清,倒置輕輕瀝干殘余液體,加入3-5ml 70%乙醇漂洗一遍,最高速離心5分鐘,棄上清,晾干沉淀。
DNA沉淀如果干燥過頭,DNA將無法wan全溶解,但是如果乙醇沒有晾干揮發(fā)干凈,殘留太多,也會造成DNA無法wan全溶解。
7. 加入1.4 ml 溶液P1wan全溶解沉淀團塊,注意附著在側(cè)壁上的質(zhì)粒沉淀雖然看不見,也要吹打側(cè)壁涮洗下來(大質(zhì)粒可用寬口吸管輕輕吹打輔助溶解)。然后將質(zhì)粒溶液轉(zhuǎn)入2個新的1.5 ml離心管中(每個700μl)。
可選步驟(一般不需要):如果菌株RNA豐富有微量RNA殘留,可在此步驟后將質(zhì)粒溶液 60℃孵育15 min消化RNA。
8. 每管加入55μl雜質(zhì)清除液A,顛倒充分混勻后加入約0.1體積(約80μl)冰預(yù)冷的內(nèi)毒素清除劑,顛倒旋轉(zhuǎn)7-10次(30秒左右)充分混勻,冰浴或者冰上放置>=5分鐘,中間偶爾顛倒混勻幾次。
內(nèi)毒素清除劑加入上清后,上清會變得渾濁,但是冰浴后應(yīng)恢復(fù)清亮。
注意:如果不需要去內(nèi)毒素用于轉(zhuǎn)染,可在此步驟只加入55μl雜質(zhì)清除液A,充分混勻后冰上放置5分鐘,離心后小心取上清轉(zhuǎn)入一個新管,直接接步驟11。
9. 42℃水浴,溶液又會變?yōu)闇啙?,顛倒混勻?2℃溫育5分鐘。
10. 室溫14,000 x g離心5 min分相(溫度低時,內(nèi)毒素清除劑無法分相,因此必須至少20℃以上室溫離心或者保證冬季轉(zhuǎn)頭溫度20℃以上)。上層水相含DNA,下層藍色油狀相含內(nèi)毒素和其它雜質(zhì)。將含DNA的上層水相轉(zhuǎn)移到新管(注意不要吸到藍色油狀層,里面含內(nèi)毒素等雜質(zhì)),棄油狀層。
溶液必須分為上下兩相,否則應(yīng)重復(fù)步驟9-10。
11. 將上一步所得上層水相中加入等體積雜質(zhì)清除液B(約750μl),輕柔混勻,4℃ 14,000 x g離心10 min,棄上清(注意不要丟失DNA),輕輕加入1 ml 70%乙醇洗滌,離心棄上清,共兩次,室溫倒置晾干5~10 min使乙醇wan全揮發(fā)。
12. 每個離心管加適量TE或者純水(50~100μl)溶解沉淀(可在37℃水浴中振蕩以輔助溶解)。要注意很多質(zhì)粒DNA可能附著在離心管側(cè)壁上,即使看不見,也應(yīng)該充分吹打側(cè)壁溶解回收質(zhì)粒DNA。
最后沉淀可以根據(jù)需要選擇任意小體積溶解,這樣可以得到很高濃度的轉(zhuǎn)染級質(zhì)粒DNA(高達3-5μg/μl)。如果有需要,客戶也可以選擇更大體積溶解。
轉(zhuǎn)染級BAC/PAC大型質(zhì)粒提取試劑盒 核酸提取